職 稱(chēng): | 研究員 |
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學(xué) 歷: | 博士研究生 |
聯(lián)系方式: | 86-27-68780215 |
電子郵件: | qiu#ihb.ac.cn(請改#為@) |
辦 公 室: | 3號實(shí)驗樓423 |
個(gè)人網(wǎng)頁(yè): | https://baike.baidu.com/item/%E9%82%B1%E4%B8%9C%E8%8C%B9/15896909?fr=aladdin |
1985.9-1989.6 華中師范大學(xué) 生物學(xué)專(zhuān)業(yè) 本科 1989.9-1992.6 華中師范大學(xué) 植物學(xué)專(zhuān)業(yè) 碩士 1998.9-2001.8 中國科學(xué)院研究生院/中國科學(xué)院水生生物研究所 水生生物專(zhuān)業(yè) 博士 2001.9-2005.3 日本慶應義塾大學(xué)/先端生命科學(xué)研究所 微生物學(xué)專(zhuān)業(yè) 學(xué)術(shù)博士 |
1992.7-1995.6 中國科學(xué)院水生生物研究所 研究實(shí)習員 1995.7-2001.8 中國科學(xué)院水生生物研究所 助理研究員 2001.9-2005.3 日本慶應義塾大學(xué)先端生命科學(xué)研究所 研究助理 2005.6-2008.3 美國西弗吉尼亞州Marshall大學(xué)醫學(xué)院 博士后 2008.6-2012.2 美國Oklahoma大學(xué)環(huán)境基因組學(xué)研究所 博士后/研究科學(xué)家 2011.3-至今 中國科學(xué)院水生生物研究所 研究員 |
水生生物學(xué)(碩士生,博士生) |
1.活性污泥微生物相關(guān)的合成生物學(xué)研究 我們長(cháng)期從事活性污泥微生物基因組學(xué)、分子遺傳學(xué)、宏基因組學(xué)和合成生物學(xué)研究,揭示微生物菌膠團形成途徑與調控機制,旨在強化活性污泥凈化功能,實(shí)現污泥減量和資源能源的回收利用。 2.微生物介導的氮循環(huán)和微生物分子遺傳學(xué)研究 在無(wú)氧和缺氧條件下,許多細菌可以利用硝酸根和亞硝酸根作為電子受體進(jìn)行無(wú)氧呼吸,稱(chēng)之為異化硝酸鹽還原(dissimilatory nitrate reduction,DNR),包括異化型硝酸鹽還原成銨(dissimilatory nitrate reduction to ammonia,DNRA)和反硝化脫氮(denitrification)兩種相互競爭的DNR途徑,在氮元素生物地球化學(xué)循環(huán)中扮演重要角色。我們研究細菌中這兩個(gè)途徑抉擇的分子調控機制及其應用。 |
1. 2020.1-2024.12 國家重點(diǎn)研發(fā)計劃“合成生物學(xué)”專(zhuān)項“活性污泥人工多細胞體系構建與應用”子課題“表面活性劑、阻燃劑、POPs降解元件挖掘”和“表面活性劑降解人工多細胞體系構建”(2019YFA090009,E01F0402,經(jīng)費204萬(wàn)) 2. 2020.1-2023.12 承擔國家自然科學(xué)基金與歐盟委員會(huì )環(huán)境生物技術(shù)合作項目“合成塑料降解轉化微生物菌群”課題3“合成塑料解聚酶的人工設計與定向進(jìn)化”任務(wù)3“合成塑料解聚酶的克隆”(3191101136,直接經(jīng)費45萬(wàn)) 3. 2019.1-2024.12 承擔中國科學(xué)院先導A項目“美麗中國”任務(wù)(XDA23040401, 經(jīng)費97萬(wàn)) 4. 2018.1-2020.12 主持國家自然科學(xué)基金重大研究計劃培育項目“細菌反硝化脫氮與異化型硝酸鹽還原氨化的分子決定機制研究”(91751106,直接經(jīng)費85萬(wàn)) 5. 2017.10-2019.8 主持中國科學(xué)院重點(diǎn)部署項目“人體與環(huán)境健康的微生物組共性技術(shù)研究”(中國科學(xué)院微生物組學(xué)計劃)第三課題“活性污泥微生物組功能網(wǎng)絡(luò )解析及調節機制”子課題“活性污泥功能狀態(tài)評估” (KFZD-SW-219-3-2,經(jīng)費90萬(wàn)) 6. 2016.1-2020.12 中國科學(xué)院國際合作局對外合作重點(diǎn)項目“清潔水及水務(wù)合作計劃”東非及其周邊區域課題負責人(Y625041401,經(jīng)費28萬(wàn)元) 7. 2015.1-2016.12 主持中國科學(xué)院院科普項目“一泓清水出污泥——活性污泥處理技術(shù)百年祭”(KP2015A09,4萬(wàn)元) 8. 2012.1-2016.12 中國科學(xué)院“百人計劃”擇優(yōu)資助項目(200萬(wàn)元) 9. 2011.3-2016.12 主持中科院領(lǐng)域方向課題“細菌低溫適應和無(wú)氧呼吸研究”(Y15103-1-401,150萬(wàn)元) |
今年來(lái)利用基因組學(xué)、分子遺傳學(xué)和生理生化分析初步揭示動(dòng)膠菌(Zoogloea)等活性污泥菌膠團形成菌胞外多聚物生物合成途徑及菌膠團形成與調控的分子機制,正在開(kāi)展進(jìn)一步研究和合成生物學(xué)研究。從全國多地的生活污水/工業(yè)廢水處理活性污泥中分離、純化大量菌膠團形成菌。初步揭示了希瓦氏菌抗逆和無(wú)氧呼吸特別是異化型硝酸鹽還原與調控機制。相關(guān)研究成果被新華社中英文報道并被國內外廣泛轉載,也被中科院之聲和維基百科(Wikipedia,Floc (biofilm詞條))推介。在PNAS(美國科學(xué)院院刊)、Water Research、Environmental Microbiology、Applied & Environmental Microbiology (共6篇)、Microbiology (共2篇)、Applied Microbiology and Biotechnology、Journal of Bacteriology、Ecological Engineering、BMC Microbiology(共2篇)、Archives of Microbiology發(fā)表論文六十余篇,SCI引用次數超過(guò)100次的論文三篇。
代表性論文: 1. Song Y, Mhuantong W, Liu SY, Pisutpaisal N, Wongwilaiwalin S, Kanokratana P, Wang AJ, Jiang CY, Champreda V*, Qiu DR,* Liu SJ*. Tropical and temperate wastewater treatment plants assemble different and diverse microbiomes. Appl Microbiol Biotechnol. 2021, 105(2):853-867. 2. Liu S, Dai J, Wei H, Li S, Wang P, Zhu T, Zhou J, Qiu D*. DNRA and denitrification pathways are leveraged by cyclic AMP receptor protein (CRP) paralogues based on electron donor/acceptor limitation in Shewanella loihica PV-4. Appl Environ Microbiol, 2021, 87(2): e01964-20. 3. Li S, Zhao L, Han J, Liu S, Dai J, Fu G, Qiu D*. Azoarcus halotolerans sp. nov., a novel member of Rhodocyclaceae isolated from activated sludge collected in Hong Kong. Int J Syst Evol Microbiol, 2020, 70(11):5799-5805. 4. Gao N, Xia M, Dai J, Yu D, An W, Li S, Liu S, He P, Zhang L, Wu Z, Bi X, Chen S, Haft DH, Qiu D*. Both widespread PEP-CTERM proteins and exopolysaccharides are required for floc formation of Zoogloea resiniphila and other activated sludge bacteria. Environmental Microbiology, 2018, 20(5): 1677-1692.(新華社中英文報道,“中科院之聲”微信公眾號報道;維基百科(Wikipedia)介紹) 5. Yu D, Xia M, Zhang L, Song Y, Duan Y, Yuan T, Yao M, Wu L, Tian C, Wu Z, Li X, Zhou J, Qiu D*. RpoN (σ54) is required for floc formation but not for extracellular polysaccharide biosynthesis in a floc-forming Aquincola tertiaricarbonis strain. Appl Environ Microbiol. 2017, 83(14): e00709-17. ( “中科院之聲”微信公眾號報道) 6. An W, Guo F, Song Y, Bai S, Dai J, Gao N, Wei H, Zhang L, Yu D, Xia M, Yu Y, Qi M, Tian C, Chen H, Wu Z, Zhang T*, Qiu D*. Comparative genomics analyses on EPS biosynthesis genes required for floc formation of Zoogloea resiniphila and other activated sludge bacteria. Water Research, 2016, 102: 494-504. (SCI收錄, SCI引用48次). Doi: 10.1016/j.watres.2016.06.058. (“中科院之聲”微信公眾號報道,中科院網(wǎng)站中英文報道) 7. Li R, Withers R, Dai J, Ruan J, Li W, An W, Yu D, Wei H, Xia M, Bai S, Tian C, Yu H, Qiu D*. Truncated Type IV pilin PilA108 Activates the intramembrane protease AlgW to cleave MucA and PilA108 itself in vitro. Archives of Microbiology, 2016, 198(9):885-892. 8. Wei H, Dai J, Xia M, Romine M, Shi L, Beliav A, Tiedje J, Nealson K, Fredrickson J, Zhou J, Qiu D*. Functional roles of CymA and NapC in Reduction of Nitrate and Nitrite by Shewanella putrefaciens W3-18-1. Microbiology (SGM, UK), 2016, 162(6):930-941. 9. Dai J, Wei H, Tian C, Damron F, Zhou J*, Qiu D*. An extracytoplasmic function sigma factor-dependent periplasmic glutathione peroxidase is involved in oxidative stress response of Shewanella oneidensis. BMC Microbiology, 2015, 15: 34.
專(zhuān)利: 包括授權美國發(fā)明專(zhuān)利3項和中國發(fā)明專(zhuān)利2項。 1. Hongwei D. Yu & Dongru Qiu(邱東茹). Methods of detecting and controlling mucoid Pseudomonas biofilm production(粘液型假單胞菌生物膜產(chǎn)生的檢測和控制方法)。專(zhuān)利授權國:美國。專(zhuān)利授權日:2010.8.24專(zhuān)利號:US7781166。 2. Hongwei D. Yu,Dongru Qiu, F. Heath Damron. Methods of producing bacterial alginate (生產(chǎn)細菌海藻多糖的方法), 專(zhuān)利授權日:2015.11.3, 美國專(zhuān)利,US9175322 3. Jizhong Zhou, Dongru Qiu, Zhili He, Ming Xie. Methods of producing protoporphyrin IX and bacterial mutants therefor (生產(chǎn)原卟啉IX的方法及其細菌突變株), 專(zhuān)利授權日:2016.3.1, 美國專(zhuān)利,US9273334 4. 邱東茹、夏明、柏仕杰。一種殺藻劑在控制微囊藻水華中的用途。2016.01.05專(zhuān)利號:CN201310669686.9,中國發(fā)明專(zhuān)利,已授權。 5. 邱東茹、劉雙元、高娜、戴景程、李書(shū)楊。一種移動(dòng)式凈化污水和黑臭水體的方法及裝置。2018.12.21 發(fā)明專(zhuān)利號:CN20180895621.9,中國發(fā)明專(zhuān)利,已授權。 6. 邱東茹、戴景程、周集中。一株高產(chǎn)原卟啉PPIX的希瓦氏菌基因工程菌及構建方法。2018.10.11 發(fā)明專(zhuān)利申請號:CN201811182893.0(公開(kāi),實(shí)審中) 7. 邱東茹、戴景程、周集中。一株高產(chǎn)血紅素的洛伊希瓦氏菌基因工程菌及其構建方法。發(fā)明專(zhuān)利申請號:CN201910072760.6(公開(kāi),實(shí)審中) |
2011年入選中國科學(xué)院“百人計劃”(A類(lèi),引進(jìn)國外優(yōu)秀人才),2012年獲得擇優(yōu)支持 2014年獲得湖北省自然科學(xué)獎,二等獎,省級,排名第三 1998年獲中國科學(xué)院科技進(jìn)步獎,三等獎,院級,排名第五 2004年獲日本文部科學(xué)省“學(xué)習鼓勵(Study Encouragement)賞” |
中國環(huán)境科學(xué)學(xué)會(huì )環(huán)境生物學(xué)分會(huì )副主任委員 湖北省暨武漢市微生物學(xué)會(huì )理事 中國地質(zhì)大學(xué)(武漢)兼職教授 |
在讀研究生: 陳晗(2019級博士)、王山輝(2020級博士)、王晶(2020博士)、王鑫(2021級博士) 博士留學(xué)生2名
畢業(yè)研究生: 安衛星(2015年碩士畢業(yè),在廣州湯臣倍健公司任職) 戴景程(2015年博士畢業(yè),在中國科學(xué)院水生生物研究所任職) 魏賀紅(2016年博士畢業(yè),在河北工程大學(xué)任職) 余佃貞(2017年博士畢業(yè),在中國科學(xué)院上海營(yíng)養與健康研究所任職) 夏 明(2017年博士畢業(yè),在江漢大學(xué)任職) 高 娜(2018年博士畢業(yè),在安徽農業(yè)科學(xué)院就職) 劉亞琦(2019年碩士畢業(yè),在中國科學(xué)院水生生物研究所任職) 李書(shū)楊(2020年博士畢業(yè),在國藥集團武漢生物制品所就職) 劉雙元(2020年博士畢業(yè),在生態(tài)環(huán)境部珠江流域南海海域生態(tài)環(huán)境監督管理局就職) |
歡迎有生物學(xué)與環(huán)境科學(xué)背景的考生報考。 |