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1988.8-1992.7  山東大學(xué)  微生物學(xué)  學(xué)士

1994.8-1997.7  中國科學(xué)院武漢病毒所  微生物學(xué)  碩士

2002.7-2005.7  新加坡國立大學(xué)  微生物學(xué)  博士

1992.8-1994.7  安徽省工商局質(zhì)檢科  技術(shù)員

1997.9-2000.7  中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)  生命科學(xué)學(xué)院  講師

2000.9-2002.7  美國南加州大學(xué)  訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者

2006.8-2009.7  暨南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院  副教授

2009.8-2010.7  日本長(cháng)崎大學(xué)  客座研究員

2010.8-至今  中國科學(xué)院水生生物研究所 研究員 水生生物蛋白質(zhì)組學(xué)科組組長(cháng)  博士生導師

遺傳學(xué)（碩士生，博士生）

目前的研究興趣主要集中在：

1. 蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)及其功能研究；

2. 重要模式生物的蛋白基因組學(xué)(Proteogenomics)分析；

3. 非編碼RNA與蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò )及其調控機制

1.      國家重點(diǎn)研發(fā)計劃，2016YFA0501304，蛋白質(zhì)組精準鑒定搜索引擎及技術(shù)體系，2016.7-2021.6，537萬(wàn)元，在研，課題負責人；

2.      國家自然科學(xué)基金面上項目，31870756，長(cháng)鏈非編碼RNA HOTAIR與YBX1（Y-box protein-1）蛋白相互作用調控腫瘤細胞增殖的分子機制研究，2019.1-2022.12，78萬(wàn)元，在研，課題負責人；

3.      中國科學(xué)院前沿科學(xué)重點(diǎn)研究項目，QYZDY-SSW-SMC00402，藍細菌環(huán)境適應性的功能蛋白質(zhì)組學(xué)研究，2016.9-2021.12，250萬(wàn)元，在研，課題負責人；

4.      中國科學(xué)院科研儀器設備研制項目，YJKYYQ20200051，基于微納流控芯片的單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析系統研制，2021.1-2022.12，300萬(wàn)元，在研，項目負責人；

5.      武漢市應用基礎前沿項目，20190207101143，真核生物的蛋白基因組學(xué)分析軟件的開(kāi)發(fā)和推廣，2019.9-2021.12，50萬(wàn)元，在研，課題負責人；

6.      國家自然科學(xué)基金面上項目，31570829，藍藻的琥珀酰修飾組及其在光合作用中的功能和分子調控機制研究，2016.1-2019.12，80萬(wàn)元，結題，課題負責人；

7.      中國科學(xué)院戰略性先導科技專(zhuān)項（B類(lèi)），XDB14030202，環(huán)境污染物微囊藻毒素致毒的分子機制研究，2014.7-2019.7，281萬(wàn)元，結題，課題負責人；

8.      國家自然科學(xué)基金重大研究計劃，91540102，超高分辨成像技術(shù)研究細胞內長(cháng)鏈非編碼RNA-HOTAIR與蛋白質(zhì)相互作用，016.1-2018.12，96萬(wàn)元、已結題、課題負責人；

9.      國家自然科學(xué)基金面上項目，31370746，長(cháng)鏈非編碼RNA-HOTAIR的蛋白調控網(wǎng)絡(luò )的構建及功能研究，2014.1-2017.12，80萬(wàn)元，已結題，課題負責人；

10.   國家重點(diǎn)基礎研究發(fā)展計劃（973 計劃）項目，2012CB518703，非編碼RNA-蛋白相互作用調控病原菌侵入及胞內存活的分子機制研究，2012.1-2016.12，376萬(wàn)元，已結題，課題負責人；

11.   中國科學(xué)院領(lǐng)域前沿研究項目，Y05102，藍藻的信號組學(xué)研究、2010.9-2013.12，200萬(wàn)元，已結題，課題負責人。

多年來(lái)從事功能蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域相關(guān)的研究工作，首次完成并報道了模式藍藻和硅藻的蛋白質(zhì)組精細圖譜，建立了完整的適用于各種已經(jīng)測序的模式生物蛋白基因組學(xué)分析流程；發(fā)展了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)翻譯后修飾的鑒定技術(shù)，建立了水生模式生物中蛋白質(zhì)翻譯后修飾的大規模、系統發(fā)現的技術(shù)方法；揭示了水生模式生物中磷酸化、乙?；?、琥珀?；戎匾鞍踪|(zhì)翻譯后修飾在光合作用及能量代謝過(guò)程中的功能及其分子作用機制；采用定量蛋白質(zhì)組學(xué)結合功能研究揭示了水生模式生物適應高光和缺氮等逆境的分子機制及關(guān)鍵蛋白分子；開(kāi)創(chuàng )了水生生物功能蛋白質(zhì)組學(xué)這一新的研究領(lǐng)域，解決了水生生物學(xué)研究中的一些重大科學(xué)問(wèn)題。

代表性論文（*：通訊作者）：

1. Lin X, Yang M, Liu X, Cheng Z, Ge F*. Characterization of Lysine Monomethylome and Methyltransferase in Model Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2020 Oct 29:S1672-0229(18)30224-9.

2. Liu X, Yang M, Liu Y, Ge F*, Zhao J*. Structural and Functional Insights into a Lysine Deacylase in the Cyanobacterium Synechococcus sp. PCC 7002. Plant Physiology. 2020 Oct;184(2):762-776.

3. Yang MK, Yang YH, Chen Z, Zhang J, Lin Y, Wang Y, Xiong Q, Li T*, Ge F*, Bryant DA, Zhao JD. Proteogenomic analysis and global discovery of posttranslational modifications in prokaryotes. PNAS. 2014 Dec 30;111(52):E5633-42.

4. Yang M, Lin X, Liu X, Zhang J, Ge F*. Genome Annotation of a Model Diatom Phaeodactylum tricornutum Using an Integrated Proteogenomic Pipeline. Molecular Plant. 2018 Oct 8;11(10):1292-1307. （封面論文）

5. Wu Y, Xiong Q, Li S, Yang X, Ge F*. Integrated Proteomic and Transcriptomic Analysis Reveals Long Noncoding RNA HOX Transcript Antisense Intergenic RNA (HOTAIR) Promotes Hepatocellular Carcinoma Cell Proliferation by Regulating Opioid Growth Factor Receptor (OGFr). Molecular and Cellular Proteomics. 2018 Jan;17(1):146-159.

6. Chen Z, Zhang G, Yang M, Li T, Ge F*, Zhao J*. Lysine Acetylome Analysis Reveals Photosystem II Manganese-stabilizing Protein Acetylation is Involved in Negative Regulation of Oxygen Evolution in Model Cyanobacterium Synechococcus sp. PCC 7002. Molecular and Cellular Proteomics. 2017 Jul;16(7):1297-1311.

7. Zhang J, Yang MK, Zeng H, Ge F*. GAPP: A Proteogenomic Software for Genome Annotation and Global Profiling of Post-translational Modifications in Prokaryotes. Molecular and Cellular Proteomics. 2016 Nov;15(11):3529-3539.

8. Zheng P, Xiong Q, Wu Y, Chen Y, Chen Z, Fleming J, Gao D, Bi L, Ge F*. Quantitative Proteomics Analysis Reveals Novel Insights into Mechanisms of Action of Long Noncoding RNA Hox Transcript Antisense Intergenic RNA (HOTAIR) in HeLa Cells. Molecular and Cellular Proteomics. 2015 Jun;14(6):1447-63.

9. Xiong Q, Feng J, Li ST, Zhang GY, Qiao ZX, Chen Z, Wu Y, Lin Y, Li T, Ge F*, Zhao JD*. Integrated transcriptomic and proteomic analysis of the global response of Synechococcus to high light stress. Molecular and Cellular Proteomics. 2015 Apr;14(4):1038-53.

10. Yang M, Wang Y, Chen Y, Cheng Z, Gu J, Deng J, Bi L, Chen C, Mo R, Wang X, Ge F*. Succinylome analysis reveals the involvement of lysine succinylation in metabolism in pathogenic Mycobacterium tuberculosis. Molecular and Cellular Proteomics. 2015 Apr;14(4):796-811.

中國科學(xué)院“百人計劃”入選者（2010年）；

第十四屆湖北省自然科學(xué)優(yōu)秀學(xué)術(shù)論文一等獎（2012年）；

武漢市3551人才（2015年）；

中國科學(xué)院大學(xué)—BHPB導師科研獎（2014年）；

中國科學(xué)院武漢教育基地“優(yōu)秀研究生導師”（2018年）；

湖北省自然科學(xué)二等獎（排名第一）（2019年）；

中國科學(xué)院武漢教育基地“優(yōu)秀研究生導師”（2021年）

湖北省生化及分子生物學(xué)會(huì )常務(wù)理事；中國蛋白質(zhì)組學(xué)會(huì )理事；國際專(zhuān)業(yè)雜志Journal of Proteome Research，Current Proteomics學(xué)術(shù)編輯；國家重點(diǎn)研發(fā)計劃“蛋白質(zhì)機器與生命過(guò)程調控”重點(diǎn)專(zhuān)項會(huì )評專(zhuān)家；國家重點(diǎn)研發(fā)計劃“精準醫學(xué)研究”重點(diǎn)專(zhuān)項績(jì)效評審專(zhuān)家；湖北省“百人計劃”評審專(zhuān)家。

歡迎對蛋白質(zhì)組學(xué)和藍藻分子生物學(xué)有興趣的考生報考。