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        中國科學(xué)院水生生物研究所歡迎您的來(lái)訪(fǎng)!

        羅大極 研究員

        博士研究生
        職  稱(chēng): 研究員
        學(xué)  歷: 博士研究生
        聯(lián)系方式: 86-27-68780278
        電子郵件: luodaji#ihb.ac.cn(請改#為@)
        辦  公  室: 2號實(shí)驗樓909
        個(gè)人網(wǎng)頁(yè):
        教育經(jīng)歷

        1999.9-2003.6 武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,生物學(xué)基地班,本科

        2003.9-2008.6 武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/中國科學(xué)院水生生物研究所,遺傳學(xué)專(zhuān)業(yè),碩博連讀博士,導師:朱作言院士

        主要職歷

        2008.9-2019.5 武漢大學(xué),遺傳學(xué)系,歷任講師、副教授、碩士生導師、博士生導師

        2009.5-2013.5 中國科學(xué)院水生生物研究所,博士后,合作導師:朱作言院士、胡煒研究員

        2011.9-2012.10 香港中文大學(xué),訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者,合作導師:鄭漢其教授 (Prof. Christopher Hon Ki Chueng)

        2016.9-2017.10 美國加州大學(xué)圣地亞哥分校,訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者(CSC資助),合作導師:付向東教授 (Prof. Xiang-Dong Fu)

        2019.5-至今   中國科學(xué)院水生生物研究所,學(xué)科組長(cháng)、研究員、博士生導師

        招生專(zhuān)業(yè)

        遺傳學(xué)(博士生/碩士生)

        研究方向

        1.魚(yú)類(lèi)性別分化與性控育種

        2.魚(yú)類(lèi)RNA生物學(xué)

        承擔項目情況

        1.      2021.1-2023.12 黃鱔性別控制基礎理論與種質(zhì)創(chuàng )制研究,湖北省杰青項目,60萬(wàn)元,主持

        2.      2020.1-2022.12 魚(yú)類(lèi)遺傳育種學(xué),國家基金優(yōu)青項目,150萬(wàn)元,主持

        3.      2019.12-2022.12 中國科學(xué)院百人計劃(擇優(yōu)資助),490萬(wàn)元,主持

        4.      2019.1-2022.12 青鳉DMY基因缺失造成性反轉中性別差異miRNAs調控的機制研究,國家基金面上項目,62萬(wàn)元,主持

        5.      2015.1-2018.12 青鳉DMY基因在性別決定中的作用機制研究,國家基金面上項目,82萬(wàn)元,主持

        6.      2010.1-2012.12 斑馬魚(yú)體細胞核移植胚胎再程序化重要基因的克隆與分析,國家基金青年項目,21萬(wàn)元,主持

        科研成果

        近年來(lái),報道了黃鱔基因編輯育種技術(shù)細節(Meth Mol Biol, 2019);建立了首個(gè)動(dòng)物性反轉數據庫(ASERAnimal Sex Reversal database,http://aser.ihb.ac.cn/),系統挖掘了動(dòng)物性反轉候選因子(Sex Reversal-associated Genes, SRGs)、其調控元件以及調控網(wǎng)絡(luò )(Genomics Proteomics & Bioinformatics, 2021,封面文章);分析了黃鱔性反轉過(guò)程中血細胞的類(lèi)型和變化規律(Aquaculture, 2021);報道了黃鱔全同胞群體中雌雄個(gè)體性腺微生物組成和分布的差異,揭示了這些差異影響黃鱔雌雄個(gè)體性腺功能特別是代謝功能(Frontiers in Immunology, 2022);解析了剪接復合體重要組分bcas2調控魚(yú)類(lèi)造血干細胞分化與維持的新功能與新機制(Blood, 2019, 封面文章);發(fā)現了魚(yú)類(lèi)特有的視桿細胞發(fā)育調控新因子mafba,并揭示了不同視桿細胞亞群的發(fā)育過(guò)程和命運決定機制(PLOS Genetics, 2022);合作開(kāi)發(fā)了全基因組范圍內原位捕獲RNA-DNA相互作用全新技術(shù)GRID-seq (Nat Protocols, 2019)RNA研究新技術(shù),在Cell,Blood,Nature Protocols等國際著(zhù)名期刊上發(fā)表研究論文多篇,受到了Nature Review Genetics,Blood等國際知名期刊專(zhuān)評推介與正面評價(jià);獲中國科學(xué)院百人計劃、國家優(yōu)青和湖北省杰青等人才項目資助。

        代表性論文:

        1.    Meng K, Lin X, Liu H, Chen H, Liu F, Xu Z, Sun Y, Luo D*. Gonadal bacterial community composition is associated with sex-specific differences in Swamp eels (Monopterus albus). Frontiers in Immunology. 2022; 13: 938326.

        2.    Chen H, Zhao Y, Chen K, Wei Y, Luo H, Li Y, Liu F, Zhu Z, Hu W, Luo D*. Isolation, identification, and investigation of pathogenic bacteria from Common Carp (Cyprinus carpio) naturally infected with Plesiomonas shigelloides. Frontiers in Immunology. 2022;13: 872896.

        3.    Liu F, Qin Y, Huang Y, Gao P, Li J, Yu S, Jia D, Chen X, Lv Y, Tu J, Sun K, Han Y, Reilly J, Shu X, Lu Q, Tang Z, Xu C*, Luo D*, Liu M*. Rod genesis driven by mafba in an nrl knockout zebrafish model with altered photoreceptor composition and progressive retinal degeneration. PLOS Genetics. 2022; 18:e1009841.

        4.    Zhao Y#, Chen K#, Liu F, Jiang M, Chen Z, Chen H, Song Y, Tao B, Cui X, Li Y, Zhu Z, Chen J*, Hu W*, Luo D*. Dynamic gene expression and alternative splicing events demonstrate co-regulation of testicular differentiation and maturation by the brain and gonad in Common Carp. Frontiers in Endocrinology. 2022;12: 820463.

        5.    Li Y#, Chen Z#, Liu H#, Li Q, Lin X, Ji S, Li R, Li S, Fan W, Zhao H, Zhu Z, Hu W*, Zhou Y*, Luo D*. ASER: Animal Sex Reversal Database. Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2021.19:873-881. (Cover story)

        6.    Chen H, Liu H, Li R, Lin X, Luo H, Ji S, Hu W, Luo D*. Blood cell identification and hematological analysis during natural sex reversal in rice field eel (Monopterus albus). Aquaculture 2021; 538.

        7.    Yu S#, Jiang T#, Jia D, Han Y, Liu F, Huang Y, Qu Z, Zhao Y, Tu J, Lv Y, Li J, Hu X, Lu Z, Han S, Qin Y, Liu X, Xie S, Wang QK, Tang Z, Luo D*, Liu M*. BCAS2 is essential for hematopoietic stem and progenitor cell maintenance during zebrafish embryogenesis. Blood. 2019; 133:805-815.  (Cover story) 

        8.    Zhou B#, Li X#,*Luo D#, Lim DH, Zhou Y, Fu XD*. GRID-seq for comprehensive analysis of global RNA-Chromatin interactions. Nature Protocols. 2019; 14:2036-2068. 

        9.    Luo D, Feng K, Zhu Z, Hu W*. Genrating gene knockout Oryzias Latipes and Rice Field eel using TALENs method. Methods in Molecular Biology. 2019; 1874:489-506.   

        10. Xiao R#,*, Chen JY#, Liang Z#, Luo D, Chen G, Lu Z, Chen Y, Zhou B, Li H, Du X, Yang Y, San KM, Wei X, Liu W, Lecuyer E, Graveley BR, Yeo G, Burge CB, Zhang QM, Zhou Y, Fu XD*. Pervasive Chromatin-RNA binding protein interactions enable RNA-based regulation of transcription. Cell. 2019; 178:107-121. 

        11. Han S#, Gao M#, Liu F, Xie S, Yu S, Lu Z, Hu X, Liu X, Qin Y, Qu Z, Huang Y, Lv Y, Tu J, Li J, Yimer TA, Tang Z, Luo D*, Chen F*, Liu M*. The knockout of USH2A in zebrafish causes hearing impairment and late onset rod-cone dystrophy. Human Genetics. 2018; 137: 779-794.  

        12. Qiu C, Cheng B, Zhang Y, Huang R, Liao L, Li Y, Luo D*, Hu W*, Wang Y*. Efficient knockout of transplanted green fluorescent protein gene in Medaka using TALENs. Marine Biotechnology. 2014; 16:674-83. (Cover story) 

        13. Liu Y#Luo D#, Lei Y, Hu W*, Zhao H*, Cheng CH*. A high effective TALEN-mediated approach for targeted gene disruption in Xenopus tropicalis and zebrafish. Methods. 2014; 69:58-66.  

        14. Luo D, Hu W*, Chen S, Zhu Z. Critical developmental stages for the efficiency of somatic cell nuclear transfer in zebrafish. International Journal of Biological Sciences. 2011; 7: 476-486.  

        15. Luo D, Hu W*, Chen S, Xiao Y, Sun Y, Zhu Z*. Identification of differentially expressed genes between cloned and zygote-developing zebrafish embryos at the dome stage using suppression subtractive hybridization. Biology of Reproduction. 2009; 80: 674-684. 

        獲獎及榮譽(yù)

        2021年獲中國科學(xué)院水生生物研究所杰出創(chuàng )新獎三等獎

        2021年獲中國科學(xué)院水生生物研究所“優(yōu)秀共產(chǎn)黨員”

        2020年獲中國科學(xué)院水生生物研究所“青年科技獎”

        2019年獲湖北五一勞動(dòng)獎?wù)?/span>

        2018年獲第四屆全國高校青年教師教學(xué)競賽理科組一等獎

        2017年獲“湖北青年教學(xué)能手”榮譽(yù)稱(chēng)號

        2016年獲湖北省第四屆高校青年教師教學(xué)競賽理科組一等獎

        2016年獲武漢大學(xué)“十佳教師”

        2015年獲武漢大學(xué)十大杰出青年(教職工)

        社會(huì )任職

        中國動(dòng)物學(xué)會(huì )斑馬魚(yú)分會(huì )理事(2021-

        中國水產(chǎn)學(xué)會(huì )水產(chǎn)生物技術(shù)與遺傳育種專(zhuān)業(yè)委員會(huì )委員(2022-

        指導研究生情況

        在讀研究生:

        陳會(huì )杰(2020級博士)、孟愷峰(2021級博士)、林星(2022級博士)

        陳圓圓(2021級碩士)、宋嘉銳(2022級碩士)

         

        畢業(yè)研究生:

        劉海榮(2022年畢業(yè),蘭州生物研究所)

         睿(2021年畢業(yè),水生所任研究助理)

        姬淑慧(2021年畢業(yè),生物公司任職)

         ?。?span lang="EN-US">2020年畢業(yè),三甲醫院任職)

        趙海萍(2020年畢業(yè),復旦大學(xué)攻讀博士學(xué)位)

        趙運通(2020年畢業(yè),生物公司任職)

         黎(2019年畢業(yè),三甲醫院任職)

         睿(2019年畢業(yè),三甲醫院任職)

        周運迪(2018年畢業(yè),政府機構任職)

         歡(2018年畢業(yè),三甲醫院任職)

        羅宇成(2018年畢業(yè),三甲醫院任職)

        王雪娟(2017年畢業(yè),清華-伯克利深圳學(xué)院攻讀博士學(xué)位)

         彬(2016年畢業(yè),三甲醫院任職)

         

        研究生獲獎:

        1. 2017年趙運通獲得碩士國家獎學(xué)金

        2. 2015年王雪娟獲得碩士國家獎學(xué)金

        備注

        歡迎考生報考